高通量qPCR芯片揭示生物炭施用下土壤有机质分子组成受细菌群落的调控
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2025-05-01 00:41:10
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本文通过田间试验,利用热解气相色谱 - 质谱联用技术(py-GC/MS)和扩增子测序、高通量qPCR等方法,研究了不同生物炭处理对水稻土土壤有机质(SOM)分子组成、细菌群落及碳循环功能基因的影响。结果表明,生物炭增加了 SOM 分子多样性,改变了其组成,使木质素衍生产品增多、脂质减少;同时改变了细菌群落结构,提高了富营养型细菌比例和核糖体 RNA 操纵子拷贝数;SOM 分子组成与细菌群落及碳循环功能基因显著相关,生物炭还增强了 SOM 分子网络复杂性。这说明生物炭可通过微生物介导过程重塑 SOM 分子组成,对生态系统功能和可持续农业生产有潜在意义。

图文导读

不同类型生物炭对SOM分子组成的影响

通过丰富度指数(richness index)和香农指数(Shannon index)评估SOM分子组成的α多样性(图1a、1b)。与仅施化肥(NPK)处理相比,生物炭的添加显著提高了SOM分子丰富度和香农指数。三种生物炭处理中,稻秆生物炭(RSB)处理的分子丰富度最高,其次是易腐废弃物生物炭(PWB)和猪粪生物炭(PMB),但香农指数无显著差异。主坐标分析(PCoA)显示,不同处理的SOM分子组成差异显著(ADONIS检验,R2=0.77R2=0.77,p<0.001p<0.001;图1c)。生物炭处理后土壤中分子组分的相对丰度变化如下(图1d):脂类(Lipids)26.1 ± 1.8%;芳香化合物(Aromatic compounds)19.5 ± 0.8%;木质素衍生物(Lignin-derived products)10.4 ± 1.3%;氮化合物(Nitrogen compounds)12.8 ± 2.8%;多糖(Polysaccharides)12.2 ± 0.8%。

与NPK处理相比,生物炭显著增加了木质素衍生物和多环芳烃(PAHs)的相对丰度,但降低了芳香化合物和脂类的丰度。PWB处理显著提高了含氮化合物和多糖的丰度,而PMB处理的含氮化合物丰度最高。

生物炭对土壤细菌群落及碳循环功能基因的影响

细菌群落结构:生物炭改变了细菌群落的组成(图2a)。变形菌门(Proteobacteria,33.52–36.38%)为优势菌群,其次是绿弯菌门(Chloroflexi,20.81–24.78%)和酸杆菌门(Acidobacteria,16.65–18.58%)。生物炭提高了拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门的相对丰度,但降低了绿弯菌门的丰度。

微生物生活史策略:生物炭显著提高了富营养型细菌(copiotrophs)的比例(图2b)及富营养型/寡营养型细菌比(copiotroph/oligotroph ratio)(图2c)。此外,生物炭增加了细菌的核糖体RNA操纵子拷贝数(rm copy number)(图2d),表明微生物代谢活性增强。

碳循环功能基因:生物炭降低了纤维素和果胶降解基因的丰度(图3c),但对碳固定基因(C-fixation genes)和碳降解基因(C-degradation genes)的总体丰度无显著影响(图3a、3b)。

SOM分子组成与细菌群落及碳循环功能基因的关联

Procrustes分析显示,SOM分子组成与细菌群落(M2=0.1357M2=0.1357,p=0.001p=0.001)及碳循环功能基因(M2=0.1346M2=0.1346,p=0.001p=0.001)显著相关(图4a、4b)。

Mantel检验表明:

多环芳烃(PAHs)与木质素降解基因(如gkx、mnp)呈负相关(p<0.05p<0.05;图5a)。

木质素衍生物与寡营养型绿弯菌门(Chloroflexi)负相关,而芳香化合物与绿弯菌门正相关(图5c)。

生物炭对SOM分子共现网络的影响

生物炭增强了SOM分子共现网络的复杂性(图6),表现为节点数(nodes)、边数(edges)和平均度数(average degree)的增加。木质素衍生物与网络复杂度呈正相关,而脂类和芳香化合物与平均度数负相关(图6c)。这表明生物炭通过促进木质素衍生物的积累,驱动了SOM分子网络的复杂化。

小结

生物炭通过直接输入有机分子(如木质素衍生物)和调控微生物群落,提高了SOM分子多样性及网络复杂性。

富营养型细菌(如变形菌门)的增殖加速了易分解有机质的代谢,而寡营养型细菌(如绿弯菌门)的减少可能与木质素衍生物的抑制效应相关。

SOM分子组成与微生物功能基因(如碳降解基因)的关联揭示了生物炭通过微生物介导过程重塑土壤碳循环的机制。

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